邹燕勤之父邹云翔，师承孟河名医费伯雄高足刘莲荪先生，精通中医各科，尤擅治肾脏病。1954年创立国内第一个肾脏病研究小组，1955年出版我国第一部肾病专著《中医肾病疗法》,是我国中医肾病学的开拓者与奠基人。曾任江苏省中医院院长28年，中央保健会诊医师30余年，一级教授，我国首批博士研究生导师。邹燕勤自幼耳濡目染、聪颖好学，在父亲的教导下诵读古文经典，打下了良好的国学根基。

1947～1950年，邹燕勤就读于南京汇文女中(今南京人民中学),因成绩优异连续获全额奖学金直至初中毕业，免去了教会学校昂贵的学杂费。I950～1953年就读于公立无锡梅村师范学校，1953年由学校保送入江苏师范学院生物系就读，后因院系调整，随系迁人南京师范学院生物系。1957年，邹燕勤毕业于南京师范学院生物系，获生物学学士学位，因成绩名列前茅而留校任植物学助教。生物学的基础，对邹燕勤认识疾病、治疗用药、科学研究等产生一定的影响。

20世纪五六十年代，适逢国家开展培养名老中医学术接班人工作，1962年2月邹燕勤奉命调入南京中医学院，正式从事中医药临床和教学工作，继承其父邹云翔的事业，同年秋天进人南京中医学院医疗系六年制本科在职学习中医，1968年取得中医学学士学位，成为中医界少见的双学士医家。毕业后她被派往南京中医学院附属医院(江苏省中医院)从事中医临床医教研工作至今。20世纪70年代初期她参加名中医学术继承班，仍师承其父邹云翔，在职学习两年，结业后被派继续跟随父亲学习。邹燕勤协助父亲医、教、研及中央保健会诊等工作20余年，门诊、病房、各地出诊、会诊时均侍诊左右，勤观细琢，深得邹云翔真传，医术渐精。