许润三幼年体弱，当时战事纷扰，局势动荡，生活环境较为艰苦。他5岁入私塾，后考人洋学堂，毕业后进入苏北联中(又名抗日大学)学习。18岁那年他因感染出现脓疱疮，并一度恶化出现水肿、昏迷，家人请来当地名医崔省三诊治，用中医药缓解了急症。少年的许润三意识到学医可以帮助自己及家人养生防病，更能济世救人，在父亲的支持下，1945年他弃文学医，拜在当地名医崔省三门下，开启了学医之路。这种传统的拜师学徒方式较为艰苦，但也为初学中医的许润三打下良好的中医功底。住在老师家，日常劳作就占去大半时间，但许润三仍抓紧一切机会学习，白天跟随老师出诊记录脉案，晚上抽空揣摩，并研读老师家藏医书。许润三于1949年授业期满，自立诊所。1953年响应政府号召，与当地4位西医大夫开设阜宁县新沟区联合诊所，并抓住当地卫生部门组织开展的“中学西”的机会，进入盐城地区中医进修班学习现代医学知识和技术。1956年他考取南京中医学院医科师资班，系统学习中医四大经典，并聆听了当时的名医大家讲座，学术上受到很大启发。毕业后被分配到北京中医学院(现北京中医药大学)任教。刚到北京中医学院时，学院师资力量不足，临床、教学任务繁重，许润三一人就承担过基础、诊断、内科等多门课程的教学工作，还要肩负内、外、妇、儿各科的临床带教工作，为其日后的临床实践打下更为坚实的基础。由于当时中医妇科师资人才匮乏，又因为许润三在中医妇科临床工作中具有扎实的理论基础和丰富的诊疗经验，1961年，他成为妇科教研室主任，从那时起，许润三就将研究方向由内科转向了妇科，一干就是60余年。1984年从北京中医药大学附属东直门医院调至中日友好医院担任中医妇科首任科主任，致力于中医妇科的学科发展，至今仍在临床、科研、教学方面进行指导。