孙申田在少年时期开始接触中医，17岁正式人行。其求学之路自有章法，师古而不泥古，博采中西法，汲取众家长，厚学而薄发。他术业专攻。尚德笃行，终有所成。

中医药学，唯有传承才能保有特色优势，唯有传承才能保有中华文化的基因与命脉。孙申田指出，医学发展至今，不可否认的是，中医医院在临床模式上都逐渐地与西医医院接近。虽然国家提出了“中医、西医、中西医结合”三者并存，但中医的传承问题依然严峻。在科学发展日新月异的今天，要成为一代名医，应该如何培养?他针对此问题提出了六个字，即传承、实践、创新。其中，关键是把握好实践这一环节。

(一)传承是根基

传承，就是要多读、读懂古代医家的原著。孙申田认为，学习中医的人，都要系统阅读中医经典和原著,并在临床实践中加以体会。比如学针灸者，要把《灵枢》《针灸大成》熟读，至少要通读一遍，才能对针灸学的古今发展和变化有个大概的了解，然后通过实践，逐渐能够知道哪些可以继承，哪些在实践中暂时看不到价值，可以扬弃。这就是师古而不泥古。实践其中有效的、有价值的部分，还可以用现代科学的方法加以研究，探索其机制，这才能有创新。

(二)实践是关键

学习中医的关键在于实践。而在中医实践中，不能要求每个人都把前人的路重走一遍。这时，继承老中医、老专家的经验便成为重中之重。中医学是一门极重经验的医学，许多治病的方法和技术，非亲身实践和体会，无法真正完全掌握。所以，中医的教育不可能完全像西医院校那样，采用批量生产的模式就能成功。正如王永炎院土所说：“实践是中医的灵魂。”如果没有实践基础，没有好的疗效，那中医理论也就成了空中楼阁，将无立足之处。中医的成长需要一个在实践中授受的过程，所以在带教过程中，孙申田都是细心指点，耐心解说，亲手传授针法。

(三)创新是精髓

中医药需要创新，但创新要以中医药传承为基础；离开传承谈中医药创新，就是无源之水、无本之木。要创新，首先就要把中医药的精髓继承下来。对中医药人才的评价，不仅只着眼于创新，更要强调创新应符合中医药传承发展的规律。没有传承，创新就失去根基；没有创新，传承就失去价值。

本着“传承、实践、创新”的理念，多年来，孙申田带领学科团队在针灸对神经科疾病治疗方面重点进行了创新性研究。自20世纪70年代始，他为揭示头针疗法治疗脑病的机理做了大量临床及科研工作。他通过“经颅重复针刺运动诱发电位研究”“电针运动区不同强度对脑影响”等一系列研究成果，从实践与理论研究等多方面证实了大脑功能定位与头皮对应关系指导选穴的正确性。强调了针刺手法与疗效的关联性，扩大了头针疗法的治疗范围，提出了头针疗法是我国自主创新的中西医结合新疗法的主张。

孙申田还提出了“孙氏经颅针刺刺激疗法”,同时为揭示头针机制提出了新的科学假说，并首次证实针刺头穴对周围神经损伤具有治疗作用。他主持的针刺促进神经损伤修复研究，从周围神经损伤的脊髓、脑研究等方面，客观证实了针刺促进神经损伤修复的作用机制。在针刺选穴配方的基本原则与方法研究方面，他根据解剖生理学原理，首次提出按照疾病损伤部位与相对应的人体解剖位置之间的关系指导选穴的方法，为临床针灸选穴配方提供了新的理论依据。