薛伯寿一直努力贯彻执行周恩来总理关于“继承发扬推广蒲老医学经验，造福于人民”的指示精神，勤奋奉献在教学临床之中。他先与戴希文，后和冉先德(著名中医学家冉雪峰之子)共同主办了卫生部、中国中医研究院西医离职学习中医班，薛伯寿担任了十多届的班主任、多门课的主讲教师。欲使学员听明白，必须对所讲内容胸有成竹，他讲每节课皆极其认真备课，在讲述思考中亦能产生智慧，教学相长。为了提高讲课水平，他同戴希文一起前往著名老中医岳美中、赵锡武家问询、聆听讲《伤寒论》《金匮要略》的心得体会。每届西学中班毕业前均请北京众多名医大家学术讲座，如董建华、赵绍琴、刘渡舟、祝谌予、路志正、刘志明等，尚有上海吴翰香、庞泮池教授等，并将他们的讲稿汇集成册。

薛伯寿对学生的要求比较严格，能因材施教。在教学中，从基础课程到经典著作，从《伤寒论》《温病学》到《中医内科学》,薛伯寿理论联系临床实践，并结合蒲老的经验讲述自己的体悟，使精深的中医理论、奥妙的中医治病经验变得通俗易懂，易于历届学员吸收领悟。另外，中国中医研究院每年主办数期高级中医提高班，皆请薛伯寿介绍蒲辅周学术医疗经验。借此他培养了大批中医、中西医结合的骨干，当年西学中班的不少学生成了如今国内学术带头人，亦有取得国际大奖者。

赴邯郸野河医疗队期间，薛伯寿任广安门医院赤脚医生大学班班主任，兼中医主讲老师，他聘请广安门医院各科主任前往讲课，亦聘请兄弟院能讲西医基础的老师。作为班主任，首先引导学员自觉刻苦学习的积极性，只有学得好，领悟深，将来为民服务，方可为赤脚医生争光。他时常对学员做考察，督促学习，更关心他们思想境界的提高，故学风非常正。毕业时，为了让同学继续深入学习，薛伯寿将节省下来的教学经费，给每一位学员都购买了当时北京新华书店里能购得的所有中医书籍。数十年来、薛伯寿每年必去邯郸数次指导学生，并为百姓义诊。在邯郸“赤脚医生”大学班毕业40年薪火传承研讨会上，时任邯郸卫生健康委员会主任周海平感慨道：“薛伯寿培养的60余位学员，现已成为我市中医界中坚力量，大多数晋升为中医高级职称，其中高社光、刘建设考入首届全国优秀临床人才，高社光终期毕业总分第一、后又被评为全国最美中医，他们现已成为有影响力的知名专家、二级教授。"

另外，1989年至1991年赴荷兰神州医药中心，薛伯寿创办了欧洲高级中医提高班。在荷兰期间边讲学，边临床指导看病。2年间，培养了20名针药并用的高级中医人才。