屠呦呦于1980年聘为硕士生导师，于2001年聘为博士生导师，已培养硕士毕业生4名，博士毕业生1名。硕士研究生吴崇明和顾玉诚分别承袭了屠呦呦做青蒿素研究的方法，研究出了传统中药延胡索、牡蒿、大蓟、小蓟的有效成分。王满元是屠呦呦的关门弟子，也是屠呦呦带过的唯一一位博士生。